Vadovybė
Sveikatos politikos ir planavimo skyrius
Korupcijos prevencijos skyrius
Vidaus audito skyrius
Ryšių su visuomene skyrius
Personalo skyrius
Finansų ir turto valdymo skyrius
Turto valdymo poskyris
ES paramos skyrius
ES reikalų ir tarptautinių ryšių skyrius
Teisės departamentas
Teisėkūros ir teisinio vertinimo skyrius
Atstovavimo ir teisės taikymo skyrius
Viešųjų pirkimų skyrius
Asmens sveikatos departamentas
Bendrosios medicinos pagalbos skyrius
Specializuotos medicinos pagalbos skyrius
Šeimos sveikatos skyrius
Sveikatos priežiūros išteklių valdymo skyrius
Bendrųjų reikalų departamentas
Informacinių technologijų skyrius
E. sveikatos skyrius
Dokumentų valdymo ir asmenų priėmimo skyrius
Ūkio skyrius
Sveikatos ekonomikos departamentas
Tarptautinės finansinės paramos skyrius
Ekonomikos skyrius
Investicijų ir programų skyrius
Sveikatos draudimo skyrius
Farmacijos departamentas
Farmacinės veiklos skyrius
Vaistinių ir farmacijos specialistų skyrius
Farmakoekonomikos ir vaistų kainodaros skyrius
Visuomenės sveikatos departamentas
Visuomenės sveikatos strategijos skyrius
Visuomenės sveikatos priežiūros skyrius
Sveikatos stiprinimo ir kurortologijos skyrius
| 
